Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtmaP26350 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtmaP26350 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtmaP26350 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtmaP26350 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtmaP26350 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtmaP26350 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtmaP26350 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtmaP26350 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtmaP26350 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtmaP26350 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtmaP26350 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtmaP26350 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtmaP26350 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtmaP26350 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtmaP26350 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtmaP26350 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms