Protein–RNA interactions for Protein: P25586

KRR1, KRR1 small subunit processome component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KRR1P25586 UTP20YBL004W 7482 nt0.32□□□□□ -2.36
KRR1P25586 OST4YDL232W 111 nt0.32□□□□□ -2.36
KRR1P25586 YJL007CYJL007C 315 nt0.32□□□□□ -2.36
KRR1P25586 YKL063CYKL063C 504 nt0.32□□□□□ -2.36
KRR1P25586 YLR434CYLR434C 384 nt0.32□□□□□ -2.36
KRR1P25586 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.31□□□□□ -2.36
KRR1P25586 YLR334CYLR334C 381 nt0.31□□□□□ -2.36
KRR1P25586 RPS25BYLR333C 327 nt0.3□□□□□ -2.36
KRR1P25586 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.3□□□□□ -2.36
KRR1P25586 VPS20YMR077C 666 nt0.3□□□□□ -2.36
KRR1P25586 YMR321CYMR321C 318 nt0.3□□□□□ -2.36
KRR1P25586 YPL225WYPL225W 441 nt0.3□□□□□ -2.36
KRR1P25586 PRP42YDR235W 1635 nt0.3□□□□□ -2.36
KRR1P25586 ULP2YIL031W 3105 nt0.29□□□□□ -2.36
KRR1P25586 FMP27YLR454W 7887 nt0.28□□□□□ -2.36
KRR1P25586 SGF11YPL047W 300 nt0.28□□□□□ -2.36
KRR1P25586 TAR1YLR154W-C 375 nt0.27□□□□□ -2.37
KRR1P25586 YJL120WYJL120W 324 nt0.26□□□□□ -2.37
KRR1P25586 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.25□□□□□ -2.37
KRR1P25586 TRS65YGR166W 1683 nt0.24□□□□□ -2.37
KRR1P25586 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.23□□□□□ -2.37
KRR1P25586 snR190snR190 190 nt0.23□□□□□ -2.37
KRR1P25586 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.22□□□□□ -2.37
KRR1P25586 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.22□□□□□ -2.37
KRR1P25586 YAR029WYAR029W 225 nt0.22□□□□□ -2.37
KRR1P25586 YLR202CYLR202C 327 nt0.22□□□□□ -2.37
KRR1P25586 YOL014WYOL014W 375 nt0.22□□□□□ -2.37
KRR1P25586 AI1Q0050 2505 nt0.22□□□□□ -2.37
KRR1P25586 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.21□□□□□ -2.38
KRR1P25586 YPL205CYPL205C 345 nt0.21□□□□□ -2.38
KRR1P25586 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.2□□□□□ -2.38
KRR1P25586 CSN9YDR179C 489 nt0.2□□□□□ -2.38
KRR1P25586 YHR138CYHR138C 345 nt0.2□□□□□ -2.38
KRR1P25586 ESP1YGR098C 4893 nt0.19□□□□□ -2.38
KRR1P25586 BIR1YJR089W 2865 nt0.17□□□□□ -2.38
KRR1P25586 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.17□□□□□ -2.38
KRR1P25586 YOR345CYOR345C 351 nt0.17□□□□□ -2.38
KRR1P25586 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.15□□□□□ -2.38
KRR1P25586 QCR9YGR183C 201 nt0.15□□□□□ -2.39
KRR1P25586 NNF2YGR089W 2811 nt0.14□□□□□ -2.39
KRR1P25586 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.13□□□□□ -2.39
KRR1P25586 ORC3YLL004W 1851 nt0.12□□□□□ -2.39
KRR1P25586 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.12□□□□□ -2.39
KRR1P25586 LEE1YPL054W 906 nt0.12□□□□□ -2.39
KRR1P25586 YBR285WYBR285W 435 nt0.12□□□□□ -2.39
KRR1P25586 RPS26AYGL189C 360 nt0.11□□□□□ -2.39
KRR1P25586 HTB2YBL002W 396 nt0.1□□□□□ -2.39
KRR1P25586 YNL324WYNL324W 396 nt0.1□□□□□ -2.39
KRR1P25586 COX12YLR038C 252 nt0.09□□□□□ -2.4
KRR1P25586 YOR121CYOR121C 306 nt0.09□□□□□ -2.4
KRR1P25586 RCO1YMR075W 2055 nt0.09□□□□□ -2.4
KRR1P25586 YER079WYER079W 633 nt0.08□□□□□ -2.4
KRR1P25586 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.08□□□□□ -2.4
KRR1P25586 AGA2YGL032C 264 nt0.08□□□□□ -2.4
KRR1P25586 YNL146WYNL146W 303 nt0.08□□□□□ -2.4
KRR1P25586 PRM3YPL192C 402 nt0.08□□□□□ -2.4
KRR1P25586 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.07□□□□□ -2.4
KRR1P25586 YKL136WYKL136W 399 nt0.07□□□□□ -2.4
KRR1P25586 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.07□□□□□ -2.4
KRR1P25586 YAR053WYAR053W 297 nt0.06□□□□□ -2.4
KRR1P25586 RPL35AYDL191W 363 nt0.05□□□□□ -2.4
KRR1P25586 YLR282CYLR282C 342 nt0.05□□□□□ -2.4
KRR1P25586 NIP1YMR309C 2439 nt0.05□□□□□ -2.4
KRR1P25586 SSS1YDR086C 243 nt0.04□□□□□ -2.4
KRR1P25586 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.04□□□□□ -2.4
KRR1P25586 YCR022CYCR022C 345 nt0.03□□□□□ -2.4
KRR1P25586 Q0017Q0017 162 nt0.03□□□□□ -2.4
KRR1P25586 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.02□□□□□ -2.41
KRR1P25586 ULI1YFR026C 510 nt0.02□□□□□ -2.41
KRR1P25586 YPR092WYPR092W 306 nt0.01□□□□□ -2.41
KRR1P25586 COG8YML071C 1824 nt0.01□□□□□ -2.41
KRR1P25586 RPS27BYHR021C 249 nt0□□□□□ -2.41
KRR1P25586 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0□□□□□ -2.41
KRR1P25586 STE5YDR103W 2754 nt-0.01□□□□□ -2.41
KRR1P25586 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.02□□□□□ -2.41
KRR1P25586 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-0.02□□□□□ -2.41
KRR1P25586 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-0.02□□□□□ -2.41
KRR1P25586 CSE2YNR010W 450 nt-0.02□□□□□ -2.41
KRR1P25586 COY1YKL179C 2040 nt-0.03□□□□□ -2.41
KRR1P25586 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.03□□□□□ -2.41
KRR1P25586 BIL1YOR304C-A 231 nt-0.03□□□□□ -2.41
KRR1P25586 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-0.04□□□□□ -2.42
KRR1P25586 YDR048CYDR048C 315 nt-0.05□□□□□ -2.42
KRR1P25586 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.06□□□□□ -2.42
KRR1P25586 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.06□□□□□ -2.42
KRR1P25586 YJR157WYJR157W 363 nt-0.06□□□□□ -2.42
KRR1P25586 YKU70YMR284W 1809 nt-0.06□□□□□ -2.42
KRR1P25586 BLI1YKL061W 342 nt-0.08□□□□□ -2.42
KRR1P25586 YLR232WYLR232W 348 nt-0.08□□□□□ -2.42
KRR1P25586 BUL2YML111W 2763 nt-0.09□□□□□ -2.42
KRR1P25586 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-0.09□□□□□ -2.42
KRR1P25586 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.1□□□□□ -2.43
KRR1P25586 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-0.1□□□□□ -2.43
KRR1P25586 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.1□□□□□ -2.43
KRR1P25586 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-0.11□□□□□ -2.43
KRR1P25586 snR45snR45 172 nt-0.11□□□□□ -2.43
KRR1P25586 THO2YNL139C 4794 nt-0.11□□□□□ -2.43
KRR1P25586 SNU13YEL026W 381 nt-0.14□□□□□ -2.43
KRR1P25586 YGR035CYGR035C 351 nt-0.14□□□□□ -2.43
KRR1P25586 YLR041WYLR041W 321 nt-0.14□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.4 ms