Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NdnP25233 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NdnP25233 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NdnP25233 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms