Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd8P23463 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms