Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klra1P20937 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klra1P20937 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klra1P20937 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klra1P20937 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klra1P20937 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms