Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms