Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms