Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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