Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PcnaP17918 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcnaP17918 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms