Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Spi1P17433 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Spi1P17433 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Spi1P17433 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Spi1P17433 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Spi1P17433 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Spi1P17433 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Spi1P17433 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Spi1P17433 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Spi1P17433 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Spi1P17433 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spi1P17433 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spi1P17433 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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