Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb1P12658 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb1P12658 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms