Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fv4P11370 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms