Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tnp1P10856 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tnp1P10856 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tnp1P10856 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Tnp1P10856 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Tnp1P10856 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Tnp1P10856 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Tnp1P10856 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms