Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem254bP0DN90 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms