Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf1P09925 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Surf1P09925 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Surf1P09925 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms