Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms