Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa5P09021 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms