Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-T23P06339 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms