Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06320 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06320 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06320 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06320 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P06320 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06320 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06320 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06320 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P06320 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P06320 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P06320 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P06320 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P06320 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P06320 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P06320 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P06320 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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