Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms