Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3pxd2aO89032 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3pxd2aO89032 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3pxd2aO89032 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3pxd2aO89032 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3pxd2aO89032 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3pxd2aO89032 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3pxd2aO89032 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3pxd2aO89032 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3pxd2aO89032 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3pxd2aO89032 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3pxd2aO89032 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3pxd2aO89032 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3pxd2aO89032 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3pxd2aO89032 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms