Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcn3O88705 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms