Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms