Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nipsnap1O55125 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms