Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms