Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NlkO54949 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NlkO54949 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NlkO54949 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NlkO54949 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NlkO54949 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NlkO54949 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NlkO54949 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NlkO54949 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NlkO54949 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms