Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NudcO35685 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NudcO35685 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NudcO35685 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NudcO35685 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NudcO35685 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NudcO35685 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NudcO35685 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NudcO35685 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NudcO35685 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NudcO35685 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NudcO35685 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NudcO35685 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NudcO35685 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NudcO35685 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NudcO35685 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NudcO35685 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NudcO35685 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NudcO35685 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NudcO35685 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NudcO35685 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NudcO35685 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NudcO35685 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NudcO35685 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NudcO35685 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NudcO35685 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NudcO35685 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NudcO35685 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NudcO35685 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NudcO35685 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NudcO35685 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NudcO35685 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NudcO35685 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NudcO35685 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NudcO35685 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms