Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpaO35216 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms