Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms