Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms