Protein–RNA interactions for Protein: O08709

Prdx6, Peroxiredoxin-6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdx6O08709 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdx6O08709 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms