Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MsmbO08540 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsmbO08540 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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