Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C9

Vmn1r117, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r117L7N2C9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r117L7N2C9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r117L7N2C9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms