Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6401L7N2C0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms