Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21310J3QQ23 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms