Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Gm20828J3KMI7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Gm20828J3KMI7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gm20828J3KMI7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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