Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubgcp6G5E8P0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms