Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r12G5E8G1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms