Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms