Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SprtnG3X912 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SprtnG3X912 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms