Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim55G3X8Y1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms