Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms