Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp72F8VQC1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms