Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r76F8VQ63 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms