Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6482F6YHC1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6482F6YHC1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms