Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17093F6XGJ4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms