Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms