Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm10477F6SW83 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm10477F6SW83 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm10477F6SW83 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm10477F6SW83 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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