Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms