Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Defa35E9QLQ1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Defa35E9QLQ1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Defa35E9QLQ1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Defa35E9QLQ1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa35E9QLQ1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Defa35E9QLQ1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Defa35E9QLQ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Defa35E9QLQ1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa35E9QLQ1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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